外泌体蛋白质组学

外泌体是具有脂质双分子结构，大小在30-150 nm之间的一种细胞外囊泡；是由多泡体 (MVB) 与细胞质膜融合后，由不同类型细胞在各种生理和病理条件下分泌。 通过蛋白质、代谢物、脂质和核酸的传递，外泌体在细胞间通讯中起着至关重要的作用。 外泌体存在于大多数体液（如血液、母乳、唾液、尿液、胆汁、胰液、脑脊液和腹膜液）和细胞培养上清液中，携带起源细胞的各种生物活性分子；在疾病的诊断、机制研究、治疗、预后评判中具有非常重大的价值。

样本形式

体液（血浆血清、尿液），细胞

样本要求

● 样本量：血液样本>1 mL（注意用EDTA防凝）；血清>0.5 mL；尿液>2 mL；细胞>5×10^7

● 尽量避免使用表面活性剂（SDS、Triton-X）和无机盐

样本运输

独立密封干冰盒运输

实验流程选项

● 基本流程：外泌体提取，超速离心，EVtrap → 多肽组制备（含定量标记） → LC-MS/MS 分析 → 生信分析

测试报告

● 实验步骤（中英文）

● 质谱仪采集的原始数据

● 蛋白质定性定量结果

1）列表输出：特征多肽及对应蛋白质定性

2）可视化视图呈现：特性分析图、PCA分布图，GO（亚细胞定位、分子功能、生物过程），KEGG信号通路。

参考文献

1. The present and future of the mass spectrometry-based investigation of the exosome landscape. Mass Spectrom Rev 39, 745-762 (2020).

2. Plasma-derived extracellular vesicle phosphoproteomics through chemical affinity purification. J Proteome Res 19, 2563-2574 (2020).

3. Specificities of exosome versus small ectosome secretion revealed by live intracellular tracking of CD63 and CD9. Nat Commun 12,  (2021).

4. Isolation of exosome nanoparticles from human cerebrospinal fluid for proteomic analysis. Acs Appl Nano Mater 4, 3351-3359 (2021).

5. Overview of extracellular vesicles, their origin, composition, purpose, and methods for exosome isolation and analysis. Cells-Basel 8,  (2019).