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修饰蛋白质组学

 

激酶抑制剂筛选

 

蛋白质激酶在信号传导中起着重要的作用,涉及多种复杂细胞功能和途径的关键酶。 蛋白激酶的异常调节或突变导致许多疾病(包括肿瘤)的发生发展。体内激酶抑制剂筛选基本上可以反映这些抑制的在细胞活性。

 

样本形式

新鲜冷冻组织,FFPE组织,血液,细胞

 

样本要求

● 样本量:动物组织>1 g;植物组织>200 mg;血液样本>1 mL(注意用EDTA防凝);细胞>5×10^7

● 尽量避免使用表面活性剂(SDS、Triton-X)和无机盐

 

样本运输

独立密封干冰盒运输

 

实验流程选项

● 基本流程:细胞裂解液抑制剂作用 desthiobiotin-ATP → 多肽组制备、TMT标记及混合、Steptavidin 富集 → DDA LC-MS/MS、msxSIMLCMS/MS(Less abundant)分析 → Kinase active-site peptides IDs, abundance, IC50

 

测试报告

● 实验步骤(中英文)

● 质谱仪采集的原始数据

● 蛋白质定性定量结果

1)列表输出:多肽及对应蛋白质定性,含激酶活性位点多肽及对应蛋白质定量

2)可视化视图呈现:韦恩图,火山图,聚类热图,GO(亚细胞定位、分子功能、生物过程),KEGG信号通路。

 

参考文献

1. In situ kinase profiling reveals functionally relevant properties of native kinases. Chem Biol 18, 699-710 (2011).

2. Selectivity profile of the tyrosine kinase 2 inhibitor deucravacitinib compared with janus kinase 1/2/3 inhibitors. Dermatology Ther 11, 1763-1776 (2021).

3. Pharmacokinetic profile of gilteritinib: A novel FLT-3 tyrosine kinase inhibitor. Clin Pharmacokinet 59, 1273-1290 (2020).

4. Comparative analysis of drug response and gene profiling of HER2-targeted tyrosine kinase inhibitors. Brit J Cancer 124, 1249-1259 (2021).

5. Combinatorial drug treatments reveal promising anticytomegaloviral profiles for clinically relevant pharmaceutical kinase inhibitors (PKIs). Int J Mol Sci 22,  (2021).

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