修饰位点二次定位确认分析
磷酸化、O-糖基化等在串级质谱解离中容易产生中性丢失;串级质谱中不包括修饰基团的碎片离子的丰度往往比相应的包含修饰基团的碎片离子的强度要高,这些高丰度碎片离子使得基于离子强度和概率统计的定位方法较难进行高效、准确位点定位。
实验流程选项
● 磷酸化、O-糖基化等多肽数据库定性搜索结果,经 P-bracket 等进行专门的修饰位点定位分析。
测试报告
● 实验步骤(中英文)
● 质谱仪采集的原始数据
● 翻译后修饰位点
参考文献
1. Accurate phosphorylation site localization using phospho-brackets. Analytica Chimica Acta, 996, 38-47 (2017).
2. A large synthetic peptide and phosphopeptide reference library for mass spectrometry-based proteomics. Nature Biotechnology, 31, 557 (2013).
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